В дореволюционной России функции охраны государственного строя выполняли жандармские управления как местные учреждения 3-го Отделения собственности его императорского величества канцелярии (до 1880 года) и Министерство внутренних дел.

Воронежское губернское жандармское управление было создано в 1867 году. После установления советской власти возникли новые учреждения государственной безопасности.

03.06.1918 года Воронежский губернский исполнительный комитет организовал Чрезвычайную Комиссию (ЧК) по борьбе с контрреволюцией, спекуляцией и преступностью в составе 5 членов. К 15.09.1918 году были созданы уездные Чрезвычайные Комиссии, в городе Воронеже - дорожно-транспортная Чрезвычайная Комиссия. Начальником губернской Чрезвычайной Комиссии были: Н.П. Павлуновский, О.П.  Хинценбергс, Т.В. Рындин, В.И. Витлицкий, Н.Е. Алексеевский, И.И. Латоузов, Д.Я. Кандыбин. В 1922 году Всероссийский Центральный Исполнительный Комитет упразднил Всероссийскую чрезвычайную комиссию по борьбе с контрреволюцией и саботажем и её местные органы. Вместо них было создано Объединённое государственное политическое управление при Совете Народных Комиссаров СССР.

Основное направление деятельности: защита социалистического государства от внешних и внутренних угроз. Полномочными представителями Объединённого государственного политического управления СССР в Воронежской губернии (с 1928 года в Центрально-Чернозёмной области) были: Д.Я. Кандыбин, И.А. Шевелев, А.И. Торопкин, И.А. Апетер, Н.Н. Алексеев, С.С. Дукельский. В 1934 году на базе Объединённого государственного политического управления СССР образован Народный комиссариат внутренних дел СССР. В середине 1930-х годов Народный комиссариат внутренних дел стал аппаратом проведения массовых политических репрессий. Только в 1937-1938 годах в Воронежской области «тройками» Народного комиссариата внутренних дел были осуждены 16 157 человек, из них к расстрелу - 9 427 человек. Среди репрессированных были и некоторые сотрудники Воронежского управления Народного комиссариата внутренних дел. Начальник управления Народного комиссариата внутренних дел по Воронежской области: П.А. Коркин, К.Е. Денисов, С.Ф. Письменский.

Во время Великой Отечественной войны Воронежским Управлением были созданы истребительный батальон (более 8 000 человек), 136 партизанских отрядов; разведывательно-диверсионные группы, 2 школы по подготовке радистов, разведчиков и подрывников. В прифронтовой полосе работали оперативно-чекистские группы. Десятки воронежцев героически погибли, выполняя специальные задания Управления Народного комиссариата внутренних дел на оккупированных территориях. В сентябре 1942 года сводный истребительный отряд Народного комиссариата внутренних дел участвовал в наступательных операции на Чижовском плацдарме. В 1942-1945 годах чекисты занимались выявлением немецкой агентуры, розыском палачей, изменников Родины, добыванием документов разведывательных органов противника. Разоблачено 547 агентов разведывательных органов, арестовано 97 шпионов, заброшенных на территорию Воронежской области. Разыскано и предано суду 266 изменников Родины. Начальники Воронежского Управления Народного комиссариата внутренних дел в годы Великой Отечественной войны: Н.А. Голубев, И.Г. Прошаков.

В 1943 году из Народного комиссариата внутренних дел был выделен Народный комиссариат государственной безопасности СССР. В 1946 году Народный комиссариат государственной безопасности СССР был переименован в Министерство государственной безопасности (МГБ) СССР. В 1953 году Министерство государственной безопасности было слито с Министерством внутренних дел СССР. В 1954 году был образован Комитет государственной безопасности (КГБ) при Совете Министров СССР. Начальники Воронежского управления Комитета государственной безопасности: В.Н. Суходольский, М.М. Елисеев, П.Ф. Храпунов, Д.К. Вишневский, Д.В. Григорьев, Б.И. Богомолов, Н.Г. Минаев, А.И. Борисенко.

В послевоенные годы сотрудники Управления занимались розыском государственных преступников, агентов разведывательных органов зарубежных стран. Существенное место в деятельности Управления занимала борьба против распространения антисоветской и антикоммунистической идеологии. В конце 1950-х - начале 1960-х годов Воронежские контрразведчики успешно провели операцию «Нева» - радиоигру с разведывательными службами Соединённых Штатов Америки.

В 1991 году вместо Комитета государственной безопасности было создано Агентство федеральной безопасности, затем Министерство безопасности РСФСР, в 1993 году Федеральная служба контрразведки Российской Федерации, в 1995 году Федеральная служба безопасности Российской Федерации.

Основные направления деятельности: профилактика и пресечение преступлений против конституционных основ государственной и общественно-политической жизни, борьба против терроризма, оборота наркотиков, предотвращение угрозы экономической безопасности и других сферах. В 2003 году в ходе проведения оперативно-боевого мероприятия на территории Чеченской Республики погиб подполковник Управления Федеральной службы безопасности М.И. Медведев. Начальники Воронежского Управления Федеральной службы безопасности: В.Г. Кулаков, А.Б. Андреев (с 2000 года).