Начало хранения документальных материалов в Воронежском крае относится к XVII веку, когда в делопроизводстве местных учреждений стали отлагаться документы, перешедшие в категорию так называемых старых дел.

Началу собиранию Воронежских архивов положила сделанная в 1849 году Н.И. Второвым находка комплекса документов XVII-XVIII веков - старейших из сохранившихся местных исторических материалов.

Частично разобранные и описанные Н.И. Второвым и К.О. Александровым-Дольником, они получили обиходное название «второвские короба». Дальнейшее развитие Архивного дела шло по пути приращения к «коробам» новых документов, собиравшихся членами Воронежского губернского статистического комитета и Воронежской ученой архивной комиссии.

Государственное архивное строительство началось в советское время. В 1919 году была учреждена должность уполномоченного Главархива по Воронежской губернии (её занимали И.И. Лaппo, затем К.Н. Лукьянчиков), образован губернский архив, занявшийся учётом и концентрацией документов упраздненных учреждений, частных и церковных архивов, а также сбором, советских печатных материалов. В 1920 году создано Воронежское отделение истпарта.

В 1921 году в структуре губернского отдела народного образования было образовано губернское архивное управление, реорганизованное в 1922 году в губернский отдел Центрархива. В 1923 году он был преобразован в губернское архивное бюро при губернском исполнительном комитете. В 1925 году при политической секции губернского архива был создан архив Октябрьской революции. При образовании Центрально-Чернозёмной области (1928) появились облархивбюро как отделение областного исполнительного комитета (с 1932 года - архивное управление Центрально-Чернозёмной области) и два самостоятельных архива: государственный исторический архив и архив Октябрьской революции.

На территории Воронежского округа были созданы архивные бюро - в Борисоглебске, Острогожске, Россоши, Усмани. В 1930 году путем выделения из облархивбюро соответственных материалов был образован Воронежский городской архив. После расформирования Центрально-Чернозёмной области в 1934 году было образовано Архивное управление Воронежского областного исполнительного комитета, а в 1938 году - Архивное управление Народного комиссариата внутренних дел (с 1946 года - Министерства Внутренних Дел) СССР по Воронежской области.

В апреле 1941 года архив Октябрьской революции и исторический архив были объединены в Государственный архив Воронежской области.

На основе собранных истпартом документов в 1929 году был учрежден областной партархив, первым заведующим которого стал П.П. Крошицкий (1929-1935).

В октябре 1941 года партархив был эвакуирован в город Чкалов (ныне Оренбург), откуда вернулся в 1944 году. В 1962 году для организации Архивного дела  в области был образован Архивный отдел с подчинением Главархиву РСФСР и областному исполнительному комитету. После нескольких реорганизаций он получил название Архивный отдел Воронежской области (с 2005 года). В 1991 году на базе партархива был создан Центр документации новейшей истории, который принял в 1992 году на хранение фильтрационно-проверочные дела на бывших советских военнопленных и гражданских лиц, угнанных на принудительные работы в Германию, а также архивно-следственные дела на необоснованно репрессированных лиц. В 2004 году этот архив стал именоваться Государственным архивом общественно-политической истории Воронежской области.

Ныне здесь хранятся документы комсомольских и партийных органов, учреждений бывшего Управления Комитета государственной безопасности по Воронежской области, общественно-политических партий и общественных организаций, а также документы личного происхождения (3 579 фондов, 797 000 дел).

В настоящее время сеть архивных учреждений Воронежской области состоит из Архивного отдела Воронежской области, Государственного архива общественно-политической истории Воронежской области, Государственного архива Воронежской области, межведомственного архива Управления делами администрации городского округа города Воронеж (1992) и 33 муниципальных архивов. Кроме того, имеется более 2 000 ведомственных архивов. В целом архивный фонд Воронежской области насчитывает более 2 000 000 дел. Местные архивы внесли существенный вклад в реализацию Закона Российской Федерации «О реабилитации жертв политических репрессий», выдав более 50 000 справок о репрессированных лицах.

С 2004 года издается научно-информационный бюллетень «Воронежский вестник архивиста».

С 2007 года существует специальный областной государственный архив, где хранятся документы по личному составу ликвидированных и реорганизованных учреждений и предприятий.